得率低的两大类原因
得率低主要分为两类:一是样本本身核酸含量低,二是提取过程中核酸损失。排查时优先判断样本来源,再检查操作环节。
样本相关的低得率
样本核酸含量本身低
石蜡包埋组织、FFPE 样本、陈旧样本或固定过久的样本核酸往往降解严重且含量低。这类样本建议增加起始用量或选用专用提取试剂盒。
细胞或组织量不足
培养细胞数量不足、活检组织量少时,得率自然偏低。提取前可通过细胞计数或估算组织重量判断是否足够。
操作相关的低得率
裂解不充分
裂解液用量不足、裂解时间不够或匀浆不彻底都会导致得率下降。组织样本需要充分匀浆,细胞样本裂解后应观察是否还有明显沉淀。
洗脱不彻底
洗脱液用量过少或孵育时间不足会导致核酸残留。延长洗脱液孵育时间到 5-10 分钟,或分两次洗脱能显著提高得率。
离心条件不当
过高的离心力或过长的离心时间可能导致沉淀松散流失。严格按照试剂盒说明的离心条件操作。
优化建议
增加洗脱液孵育时间、使用温热的洗脱液(RNA 建议 60-70°C)、选择合适的洗脱体积都是有效的优化手段。
本文用于科研实验排查与条件优化,不替代实验室 SOP、试剂说明书或医学判断。